Переходить на что-то поновее... ))))))))))))))
А если серьезно:
Создайте/скачайте восстановительный CD от того-же Acronis True Image, загрузитесь с него и создавайте себе резервные копии диска хоть с какой системой.
Копию жесткого диска можно сделать используя загрузочный диск. Тогда Ваша Win98, вообще, не причем. Вы просто переносите информацию с одного HDD на другой.
Подключите второй диск на компьютере. Вставьте какой-нибудь загрузочный диск с программами "Работа с HDD". Желательно не очень новый. У меня так хранится за 2004 год. Смотрю по списку раздела "Работа с HDD": Acronis Migrate Easy - программа предназначена для быстрого и эффективного переноса данных с одного жесткого диска на другой. Можно и другими программами переносить информацию путем посекторного копирования, причем, многие программы "понимают" различие в размерах исходного и целевого HDD.
Я использую и сейчас прогу под название Norton Ghost Solution Suite, это не Norton Ghost. Прога не требует установки, там просто exe файл. Она используется не совсем для домашнего использования, и используется на фабриках. Для DOS и для Windows. Делаем загрузочную флэшку с досом копируем туда файл и готово.
Работает независимо от Винды, поддерживает кучу дисков, SATA втч SSD. У меня версия 2012 года, свежее пока не нашел.